logo

IPIS

Intellectual Property Information System

developed by DIRBT UI

SEKUENS NUKLEOTIDA UNIK GEN rdxA Helicobacter pylori YANG MENGALAMI INSERSI DUA ASAM AMINO PADA SAMPEL BLOK PARAFIN BIOPSI LAMBUNG PENYEBAB RESISTENSI METRONIDAZOL

Invention Type: Patent / Case Number: #409

Deskripsi

Invensi ini berhubungan dengan penemuan baru sekuens gen rdxA H.pylori unik yang mengalami insersi dua asam amino penyebab resistensi metronidazol. Penemuan ini telah melalui proses uji nested PCR, sekuensing dan analisis bioinformatika (analisis perubahan asam amino, konformasi protein dan penambatan molekuler / docking). Berdasarkan laporan dari berbagai literatur di dunia belum ada hasil yang menjelaskan terdapatnya penambahan 6 basa DNA yaitu TGGTAT yang berada di antara posisi basa 259 dan 266, seperti yang telah ditemukan pada penelitian ini. Insersi nukleotida ini menyebabkan penambahan dua asam amino yaitu leusin (L) dan valin (V) yang berada di antara posisi 87 dan 88. Penambahan 2 asam amino pada penelitian ini tidak menyebabkan terjadinya mutasi frameshift. Berdasarkan hasil analisis docking, gen rdxA yang mengalami insersi dua asam amino ini membentuk interaksi ikatan hidrogen antara reseptor dan metronidazol terjadi pada posisi Tyr143 yang merupakan bukan sebagai situs aktifnya. Hal ini mengakibatkan metronidazol menjadi kurang efektif dalam menghambat H.pylori (resisten).

Inventor

Informasi Patent

IDS000006794

Granted