Invention Type: Patent / Case Number: #409
Invensi ini berhubungan dengan penemuan baru sekuens gen rdxA H.pylori unik yang mengalami insersi dua asam amino penyebab resistensi metronidazol. Penemuan ini telah melalui proses uji nested PCR, sekuensing dan analisis bioinformatika (analisis perubahan asam amino, konformasi protein dan penambatan molekuler / docking). Berdasarkan laporan dari berbagai literatur di dunia belum ada hasil yang menjelaskan terdapatnya penambahan 6 basa DNA yaitu TGGTAT yang berada di antara posisi basa 259 dan 266, seperti yang telah ditemukan pada penelitian ini. Insersi nukleotida ini menyebabkan penambahan dua asam amino yaitu leusin (L) dan valin (V) yang berada di antara posisi 87 dan 88. Penambahan 2 asam amino pada penelitian ini tidak menyebabkan terjadinya mutasi frameshift. Berdasarkan hasil analisis docking, gen rdxA yang mengalami insersi dua asam amino ini membentuk interaksi ikatan hidrogen antara reseptor dan metronidazol terjadi pada posisi Tyr143 yang merupakan bukan sebagai situs aktifnya. Hal ini mengakibatkan metronidazol menjadi kurang efektif dalam menghambat H.pylori (resisten).
IDS000006794